CUT&RUN和ChIC是两种用于研究蛋白质-DNA相互作用的技术,它们有一些关键的区别:1.**技术原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技术利用抗体将感兴趣的蛋白与ProteinA-MNase相结合来进行DNA切割。ChIC的优势在于使用TF特异性抗体系住MNase,并只在结合位点裂解。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技术则是在核的轻微MNase处理后释放单核小体和TF-DNA复合物,留下寡核小体。CUT&RUN通过在冰上进行简短的消化反应,在TF结合的MNase扩散到周边的基因组和裂解可接近的染色质之前在上清中恢复TF-DNA复合物。2.**操作步骤和简便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,这可能重新引入了ChIP-seq的一些问题,如交联导致的DNA和蛋白质的化学修饰。-**CUT&RUN**:CUT&RUN简化了操作步骤,使用磁珠固定细胞核,适用于新鲜和冷冻组织样本,缩短了生成DNA测序文库的时间(1-2天)。3.**背景信号和信噪比**:-**ChIC**:ChIC产生的背景信号可能较高,因为它可能涉及到非特异性的DNA切割。
在比较BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶对于复杂DNA片段扩增的适用性时,以下是一些关键点:1.**TaqDNA聚合酶**:-TaqDNA聚合酶因其高热稳定性和扩增效率而被应用于常规PCR。它扩增速度为30-60秒/kb,缺乏3'→5'核酸外切酶活性,无校正功能,易产生错配碱基。-对于结构复杂的模板,如GC含量高、有二级结构等,TaqPlus可以用于扩增,能有效地扩增10kb以下的片段。-有产品如TitaniumTaqDNA聚合酶,它是通过基因工程改造的Taq酶,缺失了5'-3'外切酶活性,具备更强大的扩增性能,适合扩增高度复杂的DNA混合物。2.**BstDNA聚合酶**:-BstDNA聚合酶具有高适温度,能够适应更加苛刻的扩增条件,同时消除DNA二级结构,因而能够准确并且均匀地扩增全基因组序列。-BstDNA聚合酶大片段能够优先扩增短片段的DNA,并且能够确保扩增得到的DNA覆盖了整个基因组,连贯并且无偏地扩增所有的遗传位点。-翌圣生物HieffCanace®PlusHigh-FidelityDNAPolymerase基于PfuDNA聚合酶改造而成,其保真性是Taq酶的83倍,Pfu酶的9倍,扩增速度高达10秒/kb,扩增目的片段长达13kb,具有极强的扩增效率的模板适应性,非常适合复杂模板的高保真扩增。
确保Cre重组酶只作用于特定细胞,主要通过以下几种方式实现:1.**组织特异性启动子**:-利用组织特异性启动子控制Cre重组酶的表达,可以确保Cre酶只在特定组织或细胞中表达。这种方法通过将Cre基因置于特定细胞类型特有的启动子控制之下,实现对Cre酶表达的精确控制。2.**诱导型Cre重组酶系统**:-通过使用Cre-ERT(雌素受体突变体与Cre重组酶的融合蛋白),可以实现对Cre活性的时间控制。在无他莫昔芬诱导时,Cre-ERT与热激蛋白Hsp90结合,定位于细胞质中;当他莫昔芬给药诱导时,Hsp90脱离Cre-ERT,使Cre-ERT进入细胞核发挥基因重组的作用。这种系统相当于为Cre-Lox系统加装了一个由他莫昔芬控制的外源开关,使得体内基因编辑更具时空灵活性。3.**药物诱导的Cre系统**:-例如Tet-on系统,通过四环素或其衍生物多西环素的添加来激起基因表达。在三重转基因动物中,rtTA在特定启动子的控制下表达,多西环素与rtTA结合,Cre的表达,导致固定的报告基因重组。4.**AAV递送Cre**:-利用包含组织特异性启动子的腺相关病毒(AAV)载体可以选择性地将Cre重组酶递送至特定细胞。
牛痘DNA拓扑异构酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)在实验室中的使用主要涉及以下几个步骤:1.**DNA载体连接**:-牛痘DNA拓扑异构酶I可以用于DNA载体连接,特别是在TOPO克隆载体制备中。它能够识别并切割双链DNA末端[5’C(T)CCTT],并与DNA形成共价连接形成稳定复合物,遇到DNA的5’-OH基团后,重新连接形成完整DNA链。2.**接头连接**:-在NGS建库中,牛痘DNA拓扑异构酶I可用于接头连接。这包括将含有特定序列的接头A和接头B与酶一起孵育,以实现DNA片段的连接。3.**操作步骤**:-**质粒解旋**:将超螺旋质粒DNA与牛痘DNA拓扑异构酶I混合,在37°C下孵育5-15分钟,以实现质粒的解旋。-**接头连接**:将接头A(含CCCTT序列)和接头B(含5’OH)与牛痘DNA拓扑异构酶I混合,在37°C下孵育5-15分钟,以实现接头的连接。4.**注意事项**:-双链接头A通常5’端做NH2封闭修饰,以防止自连接;接头A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴,再长的尾巴会导致连接效率大幅下降。-双链接头B的5’端必须包含-OH。-由于该酶应用广,在不同的实验中使用策略不同,需要灵活运用,并根据具体文献进行调整。
在这个过程中,E1使用ATP的能量,在自身的活性位点的半胱氨酸残基与泛素C末端的甘氨酸残基形成硫酯键。
产品特点50× ROX Reference Dye的主要成分是高纯度的5-ROX甘氨酸,其浓度为25 µM,以50倍浓缩的形式提供。这种染料的荧光强度在PCR过程中保持稳定,不会因扩增反应而发生变化,因此可以作为理想的内部参考信号。其激发波长为575 nm,发射波长为602 nm,与多数qPCR仪器的光学系统兼容。此外,ROX Reference Dye具有良好的化学稳定性,能够在-20℃避光保存长达2年,短期使用时可在4℃保存。这种稳定性使其在实验中能够提供一致的荧光信号,减少因试剂变质导致的实验误差。性能优势校正孔间误差:qPCR实验中,由于加样量、孔位置、试管壁厚度等因素,不同孔之间的荧光信号可能存在差异。50× ROX Reference Dye能够通过校正这些非PCR相关的变化,显著提高定量的精确度。提高数据重现性:通过使用ROX染料对数据进行归一化处理,实验人员可以在较少的重复实验中获得更精确的结果,从而节省时间和资源。适用于多种仪器:50× ROX Reference Dye兼容多种主流qPCR仪器,如ABI 5700、7000、CRISPR-Cas12a(以前称为Cpf1)是一种类II型V型内切酶,偏好富含胸腺嘧啶的原间隔短回文重复序列邻近基序。Recombinant Human PVRIG(mFc Tag)
SpCas9-NLS的应用范围广泛,可用于细胞内的CRISPR/Cas9系统介导的基因编辑。Recombinant Human PVRIG(mFc Tag)
快速高效的扩增能力AdvanceFastPCRMasterMix采用了改良型的高保真DNA聚合酶,能够在极短时间内完成PCR扩增。其延伸速度可达5秒/kb,甚至在1kb以内的片段需1秒即可完成扩增。这种高速扩增能力缩短了实验时间,提高了科研效率。高保真性与高特异性该产品使用高保真DNA聚合酶,保真性远高于普通Taq酶,能够有效减少扩增错误和非特异性产物。同时,预混液中添加了特异性保护剂,即使在反复冻融后仍能保持稳定的活性。即用型预混液,操作简便AdvanceFastPCRMasterMix(2×)(WithDye)是即用型的2×预混合溶液,包含所有PCR反应所需成分,如高保真DNA聚合酶、dNTPs、优化缓冲体系和电泳指示剂。用户只需加入引物和模板即可进行扩增,简化了实验步骤,减少了人为误差。兼容性强,适用范围广该产品适用于多种类型的DNA模板,包括基因组DNA、质粒DNA和cDNA。此外,其扩增产物为平末端,可直接用于后续的克隆、测序等应用。Recombinant Human PVRIG(mFc Tag)
Probe qPCR Mix (2×):高效、特异的探针法qPCR解决方案Probe qPCR Mix (2×) 是一种为探针法实时荧光定量PCR(qPCR)设计的即用型预混液,广应用于基因表达分析、病原体检测、SNP分型和拷贝数变异分析等领域。该预混液基于TaqMan等探针技术,通过荧光信号的实时监测实现对目标DNA序列的高灵敏度定量分析。产品特点高特异性和灵敏度:采用热启动Taq DNA聚合酶和优化的反应缓冲体系,有效减少非特异性扩增,提高检测灵敏度。快速反应:支持快速qPCR程序,可在短时间内完成检测,提高实验效率。防污染系统:部分产品含有dUTP/UNG(尿嘧啶DNA糖基化酶),能够有...