Cre重组酶在基因编辑中的操作主要涉及以下几个步骤:1.**识别与结合**:-Cre重组酶首先识别并分别结合两个LoxP序列的两个反向重复序列,形成一个二聚体。2.**四聚体形成**:-两个二聚体互相靠近,形成由四个Cre分子与两个LoxP位点结合形成的四聚体复合物。3.**DNA切割与交换**:-Cre重组酶在每个LoxP位点的间隔序列中引导单链切割,产生带有3’端羟基的断裂。每个LoxP位点的两个单链分别被切割。切割产生的自由3’端与对侧的3’端进行交换和重连,形成Holliday交叉结构。4.**分子重组与解旋**:-Holliday交叉结构通过Cre酶的作用被解旋并重组,形成新的重组产物。这个过程导致两个LoxP位点之间的DNA序列被删除、反转或易位,具体效果取决于LoxP序列的排列方式(方向和位置)。5.**条件性基因编辑**:-通过建立特异性Cre小鼠,该小鼠中的Cre重组酶由特定启动子驱动,可在特定细胞或组织或全身表达Cre重组酶。与带有Lox位点的Flox小鼠杂交,子代中可以获得既带有Cre又带有Flox基因的小鼠,实现条件性基因打靶(表达或敲除靶基因)。Pfu DNA Polymerase在基因克隆中的应用:Pfu DNA Polymerase常用于基因克隆,确保DNA片段的高精度复制。Recombinant Human IL-7 Protein
BsuDNAPolymerase(LargeFragment,5U/μL)是一种来源于嗜热脂肪芽孢杆菌(Bacillussubtilis)的DNA聚合酶。这种酶保留了BsuDNAPolymeraseI的5'-3'聚合酶活性,但缺失了5'-3'核酸外切酶结构域,因此它具有链置换活性,可以用于重组酶聚合酶扩增(RPA)等恒温扩增技术。以下是BsuDNAPolymerase(LargeFragment,5U/μL)的一些关键特性和应用:1.**活性定义**:在37°C条件下,30分钟内将10nmol的dNTP掺入酸不溶性物质所需的酶量定义为1个活性单位(U)。2.**热失活条件**:75°C,20分钟。3.**酶保存液成分**:25mMTris-HCl,50mMNaCl,1mMDTT,0.1mMEDTA,50%Glycerol,pH7.4@25°C。4.**储存条件**:-25~-15°C保存,有效期2年。5.**注意事项**:-由于缺乏3'-5'核酸外切酶活性,BsuDNAPolymerase(LargeFragment)不能切除3'未配对的突出末端,因而不适用于生成平齐末端。-25°C时BsuDNAPolymerase(LargeFragment)保留50%的活性,是同温度下Klenow片段(3'-5'exo-)的两倍。6.**应用**:-随机引物法标记。-cDNA第二条链的合成。-单个dA的加尾。-链置换的DNA合成。Recombinant Human IL-7 ProteinPfu DNA Polymerase的热稳定性:Pfu DNA Polymerase在高温下仍保持活性,适合高温PCR反应。
为了确保PCR实验中BstDNAPolymeraseI的活性比较大化,以下是一些关键的优化措施:1.**反应缓冲液**:使用适合BstDNAPolymeraseI的反应缓冲液,如NEB提供的IsothermalAmplificationBufferIIPack,该缓冲液包含Tris-HCl、(NH4)2SO4、KCl、MgSO4和Tween®20,pH值为8.8,专为等温扩增设计。2.**反应条件**:BstDNAPolymeraseI的比较好反应温度通常在65°C左右。确保PCR仪能够精确控制并保持这一温度,以保证酶的活性和稳定性。3.**酶的浓度**:根据反应体系的需要调整BstDNAPolymeraseI的用量。过多的酶可能导致非特异性扩增,而过少则可能降低扩增效率。通常,一个单位的酶能够在65°C下,30分钟内将25nmol的dNTP掺入酸不溶性物质。4.**Mg2+浓度**:Mg2+是DNA聚合酶活性的关键辅因子。其浓度对PCR反应有影响,需要根据具体情况调整Mg2+浓度,以获得比较好的扩增效果。5.**dNTPs浓度**:dNTPs是DNA合成的基础原料,其浓度约为200-300μM较为适宜。过高会增加非特异性扩增。6.**引物设计**:设计特异性引物,通常长度为18-30个碱基,Tm(熔解温度)相近,以保证同时退火。7.**模板DNA的质量和纯度**:确保模板DNA无蛋白质、RNA和其他杂质的污染,这些杂质可能会抑制酶的活性。
蛋白A-微球菌核酸酶(pA-MNase)是一种特殊的融合蛋白,它结合了蛋白A和微球菌核酸酶(MNase,MicrococcalNuclease)的特性。以下是pA-MNase的一些关键特点和应用:1.**融合表达产物**:pA-MNase是蛋白A与微球菌核酸酶MNase的融合表达产物,因此它同时具有ProteinA的抗体结合活性和MNase的核酸内切酶活性。2.**双重功能**:由于其双重功能,pA-MNase常用于蛋白质-DNA相互作用研究,特别是在ChIC(ChromatinImmunocleavage)和CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)技术中。3.**ProteinA的特性**:ProteinA是一种发现于金黄色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)的细胞壁表面蛋白,分子量为42kDa,能特异性地与哺乳动物免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig)结合,通常结合部位为免疫球蛋白的Fc区。4.**微球菌核酸酶(MNase)的特性**:MNase是一种核酸内切酶,能够降解核酸,常用于降解蛋白质制备中存在的核酸,减少细胞裂解液的粘度,以及用于染色质结构分析和快速RNA测序。5.**反应条件**:MNase的反应条件包括1XMicrococcalNucleaseReactionBuffer,需要补充100µg/ml重组白蛋白,分子生物学级,并在37°C下孵化。使用体外转录技术合成gRNA,确保gRNA的质量和纯度,这对后续实验的成功至关重要 。
T5核酸外切酶在基因编辑中确实有应用,并且具有一些优势:1.**提高编辑效率**:根据一篇研究文章,T5核酸外切酶可以与CRISPR/Cas系统共表达或融合,以提高基因编辑的效率。这种共表达或融合可以增加indel(插入和缺失)频率,尽管增加的幅度可能不大。2.**增强基因编辑效果**:在另一项研究中,通过使用螺旋-螺旋二聚体肽(coiled-coilpeptides)将T5核酸外切酶招募到Cas9或Cas12a蛋白上,可以提高基因编辑的效率,这种方法被称为CCExo(CRISPR-Coiled-coil-Exonuclease)。这种招募方式优于共表达和直接融合,其中强的亲和力CC对显示出高的突变频率和删除长度。3.**应用于多种细胞类型**:CCExo系统在多种细胞系和原代细胞中都能有效地提高基因失活效率,并且在慢性髓性白血病(CML)患者的原代细胞以及异种移植动物模型中展示了其应用潜力,这表明CCExo方法可能成为CML和其他遗传性疾病的潜在选择。T5核酸外切酶与CRISPR核酸酶蛋白进行融合,并引入了核定位信号(NLS)序列以构建表达载体,用于基因编辑。综上所述,T5核酸外切酶在基因编辑中的应用可以增强编辑效率和效果,尤其是在与CRISPR/Cas系统结合使用时。Endo H 是一种糖蛋白特异性的酶,主要作用于含有 N - 连接寡糖链的糖蛋白,对其他类型的生物大分子如核酸。Recombinant Human IL-7 Protein
通过测序或基于PCR的方法(如T7E1酶切和测序)来验证gRNA的编辑效率,筛选出效率高的gRNA序列 。Recombinant Human IL-7 Protein
qPCR(定量聚合酶链式反应)检测结果的准确性可能受到多种因素的影响,以下是一些关键因素:1.**引物和探针设计**:引物和探针的设计质量对qPCR的成功至关重要。不合适的引物设计可能导致低特异性或效率低的PCR反应。引物的选择应考虑引物的长度、Tm值(解离温度)和GC含量,以确保其适用于特定的核酸模板。2.**模板质量和纯度**:模板的质量和纯度直接影响qPCR的结果。污染或降解的模板可能导致偏差或虚假阳性结果。使用质量高、纯度高的DNA或RNA样本是确保准确和可靠的qPCR结果的关键。3.**反应条件和缓冲液**:PCR反应条件,包括温度、离子浓度和缓冲液成分,必须严格控制。温度梯度、离子浓度的变化或缓冲液成分的误配可能会影响PCR效率。4.**反应容器和耗材**:反应管、微孔板、封闭膜等反应容器和耗材的质量也会影响qPCR结果。低质量的材料可能导致样本丢失或反应失效。5.**标准曲线和校准**:标准曲线的准备和校准非常重要。不正确的标准曲线可能导致定量结果的不准确性。确保标准曲线中包含适当的对照样品,并使用线性拟合来生成准确的定量数据。6.**环境条件**:实验室温度、湿度和空气质量都可以影响qPCR实验的结果。不稳定的环境条件可能导致实验结果的不稳定性。Recombinant Human IL-7 Protein
Cre重组酶在基因编辑中的操作主要涉及以下几个步骤:1.**识别与结合**:-Cre重组酶首先识别并分别结合两个LoxP序列的两个反向重复序列,形成一个二聚体。2.**四聚体形成**:-两个二聚体互相靠近,形成由四个Cre分子与两个LoxP位点结合形成的四聚体复合物。3.**DNA切割与交换**:-Cre重组酶在每个LoxP位点的间隔序列中引导单链切割,产生带有3’端羟基的断裂。每个LoxP位点的两个单链分别被切割。切割产生的自由3’端与对侧的3’端进行交换和重连,形成Holliday交叉结构。4.**分子重组与解旋**:-Holliday交叉结构通过Cre酶的作用被解旋并重组,形成新的重组产...